De COVID-19-pandemie heeft wereldwijd een tragisch verlies aan mensenlevens veroorzaakt. En dit dodelijke virus blijft een ongekende uitdaging voor de volksgezondheid vormen. De sociale en economische ontwrichting veroorzaakt door de pandemie is verwoestend.
Hoewel we ons momenteel niet in de ideale situatie bevinden met COVID-19, blijft testen een cruciaal onderdeel. Door te testen kunnen we mensen identificeren die het virus hebben, dienovereenkomstig behandelen of hen vragen zich te isoleren om te voorkomen dat het virus zich verder verspreidt.
Testen kan ons niet alleen helpen bij het identificeren van mensen die besmet zijn met het virus, maar testen is ook belangrijk in het grotere plaatje van de volksgezondheid. Het kan wetenschappers helpen de verspreiding van de ziekte te karakteriseren, hoe besmettelijk de ziekte is en of de ziekte in de loop van de tijd muteert.
Er zijn twee belangrijke tests beschikbaar om ons hierbij te helpen: PCR- en NGS-tests (next generation sequencing). Sequentiebepaling is een essentieel hulpmiddel bij het diagnosticeren van COVID-19 en kan ons ook helpen de verspreiding van de ziekte te begrijpen. Lees hieronder verder om alles te weten te komen over sequencing en waarom het zo’n belangrijk hulpmiddel is in de strijd tegen COVID-19:
Genomen en sequencing
Het genetisch materiaal van een organisme wordt het genoom genoemd. Een genoom is in feite een reeks instructies die alle informatie bevat die nodig is om het te onderhouden en te produceren. Menselijke genomen zijn gebouwd met dubbelstrengs genomen. Je kent het misschien beter als DNA. Deze genomen hebben meer dan drie miljard basisletters.
In tegenstelling tot menselijke genomen kunnen virusgenomen bestaan uit DNA of RNA. Het COVID-19-virus is gemaakt van RNA. Het heeft een enkele korte RNA-streng die 30.000 letters lang is. Hoewel het gemakkelijk is om de genetische samenstelling van een genoom te zien, is het veel moeilijker om te lezen en te begrijpen. Wetenschappers gebruiken sequencing om het RNA of DNA van een virus te lezen en te begrijpen.
Wat is sequentiëring?
Wanneer een persoon wordt gediagnosticeerd met het coronavirus, wordt zijn monster samen met andere monsters getest. Dit wordt genomische sequencing genoemd. Tijdens dit proces doorloopt het positieve teststaafje verschillende stappen om de mucosale eiwitten van de RNA-moleculen te scheiden. Eenmaal gescheiden, worden de RNA-moleculen DNA dat kan worden gelezen en begrepen. Genomische sequencing is in het verleden om verschillende redenen gebruikt, onder meer om de bron van ziekenhuisinfecties of uitbraken van door voedsel overgedragen bacteriën op te sporen.
Waarom is volgordebepaling belangrijk?
Genomische sequencing is een techniek waarmee wetenschappers genetische informatie in RNA of DNA kunnen lezen en begrijpen. Sequencing kan worden gebruikt om de evolutie van een virus te volgen. Dit kan volksgezondheidsfunctionarissen helpen de verspreiding van het virus in de gaten te houden en de juiste regels en beperkingen op te stellen om te voorkomen dat het virus zich verder verspreidt.
Opeenvolging van COVID-19 over de hele wereld
De afgelopen maanden hebben we gezien dat landen over de hele wereld hun testinspanningen opvoeren om dit dodelijke virus te overwinnen. Als we begrijpen hoe het virus in de loop van de tijd is veranderd, kunnen we bepalen hoe lang het onopgemerkt is gebleven. Het kan ons ook helpen te bepalen welke maatregelen moeten worden genomen om de verspreiding van het virus te voorkomen totdat er een vaccin is gevonden.
Wetenschappers over de hele wereld voltooien de volgorde van COVID-19 terwijl ze met elkaar samenwerken om de bron van de uitbraken te lokaliseren. Een voorbeeld hiervan is de uitbraak in de Bay Area in Californië. Sequencing koppelde deze virusuitbraak aan een cruiseschip, dat verbonden was met de staat Washington. Deze mutatie van het virus werd voor het eerst ontdekt in China.
Sequencing is een belangrijk hulpmiddel in de strijd tegen COVID-19. Sequentiebepaling kan ons niet alleen helpen nieuwe virussen te identificeren, het kan ons ook helpen virussen op te sporen en te controleren of virussen in de loop van de tijd muteren.
Heb je hier enig idee van? Laat het ons hieronder weten in de comments of neem de discussie mee naar onze Twitter of Facebook.
Aanbevelingen van de redactie:
